РНК-секвенирование выявляет мутации генов на ранней стадии развития опухоли

Группа ученых, среди которых главный онколог «СМ-Клиника», д.м.н., профессор, отличник здравоохранения РФ А.П. Серяков, обнародовала в международном журнале «Biomedicines» результаты исследования онкогенов¹, выявленных методом секвенирования РНК.

На сегодняшний день секвенирование РНК считается наиболее передовым научным методом, который позволяет точно выявить патологические изменения в работе отдельных генов, связанных с развитием опухолей.

Как известно, каждый тип рака имеет собственный набор генов, которые определяют с помощью иммуногистохимических исследований. Этот традиционный метод анализа тканей и органов позволяет определить с помощью антител наличие или отсутствие особых белков, способствующих развитию рака, а также понять, в каких онкогенах произошли мутации.

По сравнению с иммуногистохимией новый метод диагностики рака — секвенирование РНК — выявляет патологии в генах быстрее и эффективнее, что дает возможность ученым обнаружить раковую опухоль на ранней стадии и подобрать для пациента правильную терапию с использованием таргетных препаратов².

По мнению ученых, одной из основных причин мутаций генов при различных типах рака являются перестройки в хромосомах ДНК. Они представляют особый интерес для исследователей, так как могут быть использованы в качестве материала для разработки новых противораковых препаратов.

Сегодня в современной онкотерапии применяется ряд таргетных препаратов, которые уже доказали свою эффективность в лечении пациентов с хроническим миелоидным лейкозом, а также других типов злокачественных новообразований.

Некоторые из этих препаратов были назначены онкобольным пациентам, участвовавшим в клиническом исследовании с применением метода секвенирования РНК. Всего в исследовании принимали участие 764 пациента с разными типами рака, включая 96 пациентов с лейкозами, среди которых были пациенты «СМ-Клиника».

В рамках эксперимента ученые исследовали клинически значимые гены слияния 3’RTK: ABL1, ALK, ERBB2, FGFR1-4, NTRK1-3, RET и ROS1. В результате с помощью секвенирования РНК было установлено, что именно эти гены являются биомаркерами злокачественных опухолей.

Таким образом, новый метод позволяет ученым обнаружить с высокой точностью специфические слияния генов в образцах раковых опухолей и является важным шагом в определении их структуры на молекулярном уровне. Кроме того, благодаря полученным на его основе данным можно подобрать индивидуальную терапию для каждого отдельного больного и улучшить прогноз онкозаболеваний.

¹ Experimentally Deduced Criteria for Detection of Clinically Relevant Fusion 3′ Oncogenes from FFPE Bulk RNA Sequencing Data, «Biomedicines», Volume 10, №8, 1866, от 02.08.2023.

² Таргетные препараты — группа онкопрепаратов, которые используются в терапии онкобольных пациентов для выявления и уничтожения раковых клеток. Более того, они останавливают рост новых опухолей и не наносят вреда организму в целом.